Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFEP18615 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFEP18615 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFEP18615 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFEP18615 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFEP18615 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFEP18615 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFEP18615 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFEP18615 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFEP18615 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFEP18615 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFEP18615 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFEP18615 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFEP18615 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFEP18615 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFEP18615 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFEP18615 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NELFEP18615 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NELFEP18615 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NELFEP18615 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NELFEP18615 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NELFEP18615 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NELFEP18615 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NELFEP18615 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NELFEP18615 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NELFEP18615 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NELFEP18615 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NELFEP18615 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NELFEP18615 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NELFEP18615 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NELFEP18615 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NELFEP18615 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFEP18615 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFEP18615 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFEP18615 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFEP18615 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFEP18615 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFEP18615 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFEP18615 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFEP18615 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFEP18615 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFEP18615 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFEP18615 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFEP18615 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFEP18615 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFEP18615 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFEP18615 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFEP18615 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFEP18615 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFEP18615 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFEP18615 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFEP18615 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFEP18615 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFEP18615 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFEP18615 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFEP18615 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFEP18615 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFEP18615 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFEP18615 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFEP18615 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFEP18615 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFEP18615 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFEP18615 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFEP18615 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFEP18615 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFEP18615 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFEP18615 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFEP18615 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFEP18615 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFEP18615 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFEP18615 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFEP18615 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFEP18615 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFEP18615 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFEP18615 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFEP18615 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFEP18615 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFEP18615 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFEP18615 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFEP18615 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFEP18615 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFEP18615 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFEP18615 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms