Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RHCEP18577 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RHCEP18577 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHCEP18577 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHCEP18577 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RHCEP18577 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHCEP18577 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHCEP18577 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHCEP18577 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHCEP18577 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHCEP18577 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHCEP18577 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RHCEP18577 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RHCEP18577 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHCEP18577 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHCEP18577 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RHCEP18577 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RHCEP18577 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHCEP18577 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHCEP18577 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHCEP18577 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHCEP18577 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHCEP18577 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHCEP18577 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHCEP18577 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHCEP18577 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHCEP18577 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHCEP18577 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHCEP18577 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHCEP18577 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHCEP18577 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHCEP18577 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHCEP18577 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHCEP18577 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHCEP18577 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHCEP18577 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHCEP18577 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHCEP18577 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHCEP18577 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHCEP18577 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHCEP18577 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHCEP18577 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHCEP18577 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHCEP18577 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHCEP18577 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RHCEP18577 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RHCEP18577 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHCEP18577 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHCEP18577 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHCEP18577 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHCEP18577 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHCEP18577 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHCEP18577 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RHCEP18577 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHCEP18577 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHCEP18577 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHCEP18577 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHCEP18577 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHCEP18577 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHCEP18577 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHCEP18577 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHCEP18577 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHCEP18577 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHCEP18577 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHCEP18577 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RHCEP18577 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHCEP18577 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHCEP18577 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHCEP18577 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms