Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB5P18084 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB5P18084 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms