Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
UBTFP17480 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
UBTFP17480 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
UBTFP17480 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
UBTFP17480 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
UBTFP17480 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
UBTFP17480 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
UBTFP17480 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
UBTFP17480 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
UBTFP17480 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
UBTFP17480 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
UBTFP17480 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
UBTFP17480 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
UBTFP17480 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
UBTFP17480 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
UBTFP17480 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
UBTFP17480 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
UBTFP17480 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
UBTFP17480 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
UBTFP17480 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
UBTFP17480 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
UBTFP17480 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
UBTFP17480 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
UBTFP17480 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
UBTFP17480 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
UBTFP17480 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
UBTFP17480 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
UBTFP17480 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
UBTFP17480 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
UBTFP17480 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
UBTFP17480 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
UBTFP17480 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
UBTFP17480 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
UBTFP17480 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
UBTFP17480 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
UBTFP17480 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
UBTFP17480 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
UBTFP17480 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
UBTFP17480 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
UBTFP17480 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
UBTFP17480 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
UBTFP17480 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
UBTFP17480 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.46
UBTFP17480 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
UBTFP17480 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
UBTFP17480 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
UBTFP17480 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
UBTFP17480 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
UBTFP17480 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
UBTFP17480 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
UBTFP17480 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
UBTFP17480 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
UBTFP17480 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
UBTFP17480 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
UBTFP17480 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
UBTFP17480 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
UBTFP17480 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
UBTFP17480 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
UBTFP17480 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
UBTFP17480 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
UBTFP17480 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
UBTFP17480 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
UBTFP17480 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
UBTFP17480 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
UBTFP17480 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
UBTFP17480 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
UBTFP17480 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
UBTFP17480 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
UBTFP17480 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
UBTFP17480 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
UBTFP17480 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
UBTFP17480 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
UBTFP17480 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
UBTFP17480 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
UBTFP17480 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
UBTFP17480 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
UBTFP17480 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
UBTFP17480 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
UBTFP17480 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
UBTFP17480 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
UBTFP17480 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
UBTFP17480 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
UBTFP17480 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBTFP17480 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBTFP17480 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBTFP17480 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBTFP17480 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBTFP17480 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBTFP17480 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBTFP17480 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBTFP17480 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBTFP17480 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBTFP17480 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBTFP17480 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBTFP17480 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBTFP17480 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
UBTFP17480 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
UBTFP17480 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
UBTFP17480 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
UBTFP17480 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms