Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA2P17301 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA2P17301 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms