Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSPP15924 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSPP15924 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSPP15924 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSPP15924 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DSPP15924 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DSPP15924 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSPP15924 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSPP15924 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSPP15924 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSPP15924 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSPP15924 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSPP15924 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSPP15924 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSPP15924 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DSPP15924 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSPP15924 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSPP15924 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSPP15924 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSPP15924 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSPP15924 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSPP15924 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSPP15924 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
DSPP15924 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSPP15924 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSPP15924 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSPP15924 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSPP15924 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSPP15924 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSPP15924 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSPP15924 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DSPP15924 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSPP15924 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSPP15924 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DSPP15924 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSPP15924 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSPP15924 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSPP15924 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSPP15924 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSPP15924 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSPP15924 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSPP15924 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSPP15924 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSPP15924 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSPP15924 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSPP15924 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSPP15924 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSPP15924 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSPP15924 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSPP15924 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSPP15924 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSPP15924 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSPP15924 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSPP15924 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSPP15924 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSPP15924 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSPP15924 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSPP15924 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSPP15924 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSPP15924 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSPP15924 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSPP15924 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSPP15924 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSPP15924 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSPP15924 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSPP15924 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSPP15924 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSPP15924 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms