Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYOD1P15172 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms