Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GSPT1P15170 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GSPT1P15170 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
GSPT1P15170 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GSPT1P15170 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GSPT1P15170 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GSPT1P15170 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GSPT1P15170 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GSPT1P15170 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GSPT1P15170 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GSPT1P15170 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GSPT1P15170 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GSPT1P15170 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GSPT1P15170 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GSPT1P15170 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GSPT1P15170 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GSPT1P15170 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GSPT1P15170 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GSPT1P15170 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GSPT1P15170 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GSPT1P15170 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GSPT1P15170 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GSPT1P15170 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GSPT1P15170 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GSPT1P15170 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GSPT1P15170 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GSPT1P15170 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GSPT1P15170 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GSPT1P15170 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GSPT1P15170 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
GSPT1P15170 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GSPT1P15170 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GSPT1P15170 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GSPT1P15170 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GSPT1P15170 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms