Protein–RNA interactions for Protein: P15169

CPN1, Carboxypeptidase N catalytic chain, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPN1P15169 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPN1P15169 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPN1P15169 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPN1P15169 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPN1P15169 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPN1P15169 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPN1P15169 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPN1P15169 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPN1P15169 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPN1P15169 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CPN1P15169 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CPN1P15169 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CPN1P15169 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CPN1P15169 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CPN1P15169 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CPN1P15169 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CPN1P15169 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CPN1P15169 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPN1P15169 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPN1P15169 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPN1P15169 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPN1P15169 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CPN1P15169 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPN1P15169 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPN1P15169 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPN1P15169 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPN1P15169 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPN1P15169 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPN1P15169 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPN1P15169 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPN1P15169 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPN1P15169 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPN1P15169 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPN1P15169 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPN1P15169 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPN1P15169 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPN1P15169 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPN1P15169 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPN1P15169 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPN1P15169 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPN1P15169 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPN1P15169 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPN1P15169 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPN1P15169 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPN1P15169 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPN1P15169 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPN1P15169 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPN1P15169 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPN1P15169 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPN1P15169 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPN1P15169 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPN1P15169 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPN1P15169 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPN1P15169 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPN1P15169 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPN1P15169 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPN1P15169 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPN1P15169 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CPN1P15169 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPN1P15169 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPN1P15169 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPN1P15169 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPN1P15169 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPN1P15169 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPN1P15169 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPN1P15169 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPN1P15169 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPN1P15169 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPN1P15169 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPN1P15169 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms