Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA1P15085 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA1P15085 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA1P15085 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA1P15085 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA1P15085 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA1P15085 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA1P15085 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA1P15085 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA1P15085 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA1P15085 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA1P15085 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPA1P15085 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPA1P15085 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CPA1P15085 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CPA1P15085 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CPA1P15085 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA1P15085 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA1P15085 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA1P15085 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA1P15085 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA1P15085 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA1P15085 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA1P15085 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPA1P15085 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPA1P15085 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPA1P15085 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CPA1P15085 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPA1P15085 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPA1P15085 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CPA1P15085 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPA1P15085 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA1P15085 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA1P15085 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA1P15085 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA1P15085 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA1P15085 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA1P15085 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA1P15085 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA1P15085 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA1P15085 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA1P15085 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA1P15085 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA1P15085 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA1P15085 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA1P15085 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA1P15085 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA1P15085 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA1P15085 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA1P15085 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA1P15085 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA1P15085 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA1P15085 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA1P15085 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA1P15085 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA1P15085 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA1P15085 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA1P15085 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA1P15085 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA1P15085 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA1P15085 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA1P15085 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA1P15085 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA1P15085 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA1P15085 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA1P15085 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA1P15085 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA1P15085 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA1P15085 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA1P15085 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA1P15085 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA1P15085 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA1P15085 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA1P15085 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA1P15085 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA1P15085 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA1P15085 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA1P15085 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA1P15085 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA1P15085 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA1P15085 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA1P15085 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPA1P15085 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPA1P15085 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPA1P15085 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPA1P15085 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPA1P15085 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPA1P15085 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPA1P15085 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPA1P15085 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA1P15085 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA1P15085 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA1P15085 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA1P15085 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA1P15085 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA1P15085 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA1P15085 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA1P15085 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA1P15085 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA1P15085 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms