Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FDPSP14324 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FDPSP14324 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FDPSP14324 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FDPSP14324 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FDPSP14324 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FDPSP14324 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FDPSP14324 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FDPSP14324 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FDPSP14324 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FDPSP14324 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FDPSP14324 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FDPSP14324 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FDPSP14324 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FDPSP14324 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FDPSP14324 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDPSP14324 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDPSP14324 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDPSP14324 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDPSP14324 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDPSP14324 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDPSP14324 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDPSP14324 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDPSP14324 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDPSP14324 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FDPSP14324 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDPSP14324 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FDPSP14324 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FDPSP14324 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FDPSP14324 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FDPSP14324 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FDPSP14324 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FDPSP14324 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FDPSP14324 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FDPSP14324 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FDPSP14324 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FDPSP14324 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FDPSP14324 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FDPSP14324 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FDPSP14324 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FDPSP14324 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FDPSP14324 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FDPSP14324 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FDPSP14324 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FDPSP14324 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FDPSP14324 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FDPSP14324 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FDPSP14324 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FDPSP14324 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FDPSP14324 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FDPSP14324 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FDPSP14324 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FDPSP14324 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FDPSP14324 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FDPSP14324 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FDPSP14324 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FDPSP14324 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FDPSP14324 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FDPSP14324 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FDPSP14324 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FDPSP14324 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FDPSP14324 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FDPSP14324 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FDPSP14324 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FDPSP14324 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FDPSP14324 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FDPSP14324 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FDPSP14324 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FDPSP14324 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FDPSP14324 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FDPSP14324 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FDPSP14324 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FDPSP14324 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FDPSP14324 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FDPSP14324 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FDPSP14324 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FDPSP14324 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FDPSP14324 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FDPSP14324 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FDPSP14324 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FDPSP14324 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FDPSP14324 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FDPSP14324 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FDPSP14324 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FDPSP14324 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FDPSP14324 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FDPSP14324 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FDPSP14324 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FDPSP14324 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FDPSP14324 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FDPSP14324 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FDPSP14324 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FDPSP14324 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FDPSP14324 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FDPSP14324 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FDPSP14324 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FDPSP14324 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FDPSP14324 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FDPSP14324 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FDPSP14324 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms