Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA4P12838 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA4P12838 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms