Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT3P12035 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT3P12035 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT3P12035 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT3P12035 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT3P12035 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT3P12035 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT3P12035 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT3P12035 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT3P12035 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT3P12035 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT3P12035 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT3P12035 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT3P12035 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT3P12035 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT3P12035 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT3P12035 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT3P12035 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT3P12035 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT3P12035 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT3P12035 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT3P12035 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT3P12035 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT3P12035 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT3P12035 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT3P12035 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT3P12035 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT3P12035 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT3P12035 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT3P12035 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT3P12035 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT3P12035 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT3P12035 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT3P12035 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT3P12035 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT3P12035 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT3P12035 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT3P12035 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT3P12035 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT3P12035 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT3P12035 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT3P12035 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT3P12035 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT3P12035 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT3P12035 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT3P12035 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT3P12035 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT3P12035 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT3P12035 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT3P12035 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT3P12035 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT3P12035 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT3P12035 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms