Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC175P0C221 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC175P0C221 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms