Protein–RNA interactions for Protein: P09914

IFIT1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT1P09914 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFIT1P09914 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFIT1P09914 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
IFIT1P09914 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFIT1P09914 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IFIT1P09914 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFIT1P09914 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIT1P09914 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms