Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXB7P09629 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms