Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRBP09619 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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