Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HBQ1P09105 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBQ1P09105 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HBQ1P09105 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HBQ1P09105 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HBQ1P09105 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HBQ1P09105 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HBQ1P09105 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HBQ1P09105 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HBQ1P09105 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HBQ1P09105 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HBQ1P09105 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HBQ1P09105 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HBQ1P09105 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HBQ1P09105 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HBQ1P09105 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms