Protein–RNA interactions for Protein: P08651

NFIC, Nuclear factor 1 C-type, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFICP08651 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NFICP08651 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFICP08651 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFICP08651 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFICP08651 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NFICP08651 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFICP08651 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFICP08651 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFICP08651 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFICP08651 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFICP08651 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFICP08651 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFICP08651 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFICP08651 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFICP08651 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFICP08651 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFICP08651 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFICP08651 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFICP08651 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFICP08651 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFICP08651 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFICP08651 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFICP08651 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFICP08651 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFICP08651 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFICP08651 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFICP08651 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFICP08651 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFICP08651 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFICP08651 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFICP08651 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFICP08651 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFICP08651 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFICP08651 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFICP08651 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFICP08651 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFICP08651 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFICP08651 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFICP08651 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFICP08651 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFICP08651 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFICP08651 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFICP08651 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFICP08651 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFICP08651 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFICP08651 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFICP08651 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFICP08651 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFICP08651 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFICP08651 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFICP08651 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFICP08651 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFICP08651 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFICP08651 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFICP08651 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFICP08651 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFICP08651 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFICP08651 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFICP08651 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFICP08651 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFICP08651 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFICP08651 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFICP08651 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFICP08651 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFICP08651 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFICP08651 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFICP08651 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFICP08651 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFICP08651 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFICP08651 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFICP08651 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFICP08651 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFICP08651 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NFICP08651 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFICP08651 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFICP08651 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFICP08651 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFICP08651 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFICP08651 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFICP08651 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFICP08651 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFICP08651 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFICP08651 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFICP08651 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFICP08651 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFICP08651 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFICP08651 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NFICP08651 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFICP08651 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFICP08651 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFICP08651 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFICP08651 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFICP08651 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFICP08651 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFICP08651 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFICP08651 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFICP08651 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFICP08651 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFICP08651 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFICP08651 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms