Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM2P07951 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM2P07951 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM2P07951 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM2P07951 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM2P07951 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM2P07951 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM2P07951 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM2P07951 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM2P07951 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM2P07951 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM2P07951 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM2P07951 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM2P07951 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM2P07951 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM2P07951 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM2P07951 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM2P07951 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM2P07951 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM2P07951 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM2P07951 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM2P07951 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM2P07951 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM2P07951 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM2P07951 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM2P07951 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM2P07951 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM2P07951 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM2P07951 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM2P07951 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM2P07951 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM2P07951 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM2P07951 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TPM2P07951 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TPM2P07951 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TPM2P07951 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TPM2P07951 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM2P07951 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM2P07951 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM2P07951 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM2P07951 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM2P07951 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM2P07951 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM2P07951 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM2P07951 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM2P07951 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM2P07951 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM2P07951 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM2P07951 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM2P07951 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM2P07951 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM2P07951 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM2P07951 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM2P07951 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM2P07951 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM2P07951 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM2P07951 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM2P07951 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM2P07951 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM2P07951 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM2P07951 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM2P07951 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM2P07951 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM2P07951 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM2P07951 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM2P07951 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM2P07951 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM2P07951 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM2P07951 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM2P07951 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM2P07951 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM2P07951 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM2P07951 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM2P07951 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM2P07951 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM2P07951 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM2P07951 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM2P07951 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM2P07951 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM2P07951 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM2P07951 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM2P07951 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM2P07951 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM2P07951 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM2P07951 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM2P07951 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms