Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL1P05976 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL1P05976 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL1P05976 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL1P05976 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL1P05976 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL1P05976 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL1P05976 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL1P05976 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL1P05976 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL1P05976 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL1P05976 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL1P05976 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL1P05976 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL1P05976 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL1P05976 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYL1P05976 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYL1P05976 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYL1P05976 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYL1P05976 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYL1P05976 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYL1P05976 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYL1P05976 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYL1P05976 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYL1P05976 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYL1P05976 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYL1P05976 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYL1P05976 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYL1P05976 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYL1P05976 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MYL1P05976 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MYL1P05976 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYL1P05976 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYL1P05976 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYL1P05976 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL1P05976 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL1P05976 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL1P05976 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL1P05976 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL1P05976 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL1P05976 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL1P05976 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL1P05976 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL1P05976 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL1P05976 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL1P05976 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL1P05976 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL1P05976 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL1P05976 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL1P05976 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL1P05976 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL1P05976 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL1P05976 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL1P05976 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL1P05976 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL1P05976 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL1P05976 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL1P05976 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL1P05976 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL1P05976 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL1P05976 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL1P05976 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL1P05976 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL1P05976 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL1P05976 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL1P05976 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYL1P05976 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYL1P05976 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYL1P05976 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYL1P05976 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYL1P05976 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYL1P05976 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MYL1P05976 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MYL1P05976 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MYL1P05976 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYL1P05976 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYL1P05976 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYL1P05976 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYL1P05976 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYL1P05976 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYL1P05976 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL1P05976 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL1P05976 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL1P05976 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL1P05976 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL1P05976 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms