Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms