Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A1BGP04217 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A1BGP04217 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
A1BGP04217 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A1BGP04217 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
A1BGP04217 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A1BGP04217 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
A1BGP04217 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
A1BGP04217 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A1BGP04217 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A1BGP04217 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A1BGP04217 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
A1BGP04217 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A1BGP04217 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
A1BGP04217 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
A1BGP04217 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A1BGP04217 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A1BGP04217 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A1BGP04217 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
A1BGP04217 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
A1BGP04217 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A1BGP04217 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
A1BGP04217 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
A1BGP04217 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
A1BGP04217 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
A1BGP04217 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
A1BGP04217 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
A1BGP04217 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
A1BGP04217 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
A1BGP04217 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
A1BGP04217 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
A1BGP04217 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
A1BGP04217 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
A1BGP04217 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
A1BGP04217 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
A1BGP04217 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
A1BGP04217 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
A1BGP04217 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
A1BGP04217 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
A1BGP04217 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
A1BGP04217 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
A1BGP04217 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
A1BGP04217 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
A1BGP04217 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
A1BGP04217 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
A1BGP04217 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
A1BGP04217 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
A1BGP04217 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
A1BGP04217 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
A1BGP04217 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
A1BGP04217 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
A1BGP04217 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
A1BGP04217 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
A1BGP04217 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
A1BGP04217 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
A1BGP04217 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
A1BGP04217 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
A1BGP04217 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A1BGP04217 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A1BGP04217 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A1BGP04217 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
A1BGP04217 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A1BGP04217 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
A1BGP04217 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
A1BGP04217 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A1BGP04217 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
A1BGP04217 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
A1BGP04217 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A1BGP04217 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A1BGP04217 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A1BGP04217 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A1BGP04217 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
A1BGP04217 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A1BGP04217 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
A1BGP04217 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A1BGP04217 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
A1BGP04217 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
A1BGP04217 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
A1BGP04217 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
A1BGP04217 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
A1BGP04217 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
A1BGP04217 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
A1BGP04217 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
A1BGP04217 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
A1BGP04217 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
A1BGP04217 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
A1BGP04217 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
A1BGP04217 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
A1BGP04217 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
A1BGP04217 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
A1BGP04217 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
A1BGP04217 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
A1BGP04217 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
A1BGP04217 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
A1BGP04217 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
A1BGP04217 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
A1BGP04217 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
A1BGP04217 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
A1BGP04217 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
A1BGP04217 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms