Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYCNP04198 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYCNP04198 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MYCNP04198 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYCNP04198 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYCNP04198 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYCNP04198 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYCNP04198 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYCNP04198 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYCNP04198 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYCNP04198 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYCNP04198 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYCNP04198 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYCNP04198 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYCNP04198 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYCNP04198 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYCNP04198 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYCNP04198 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYCNP04198 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYCNP04198 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYCNP04198 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYCNP04198 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYCNP04198 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYCNP04198 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYCNP04198 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYCNP04198 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYCNP04198 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYCNP04198 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYCNP04198 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYCNP04198 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYCNP04198 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYCNP04198 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYCNP04198 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYCNP04198 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYCNP04198 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYCNP04198 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYCNP04198 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYCNP04198 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYCNP04198 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYCNP04198 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYCNP04198 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYCNP04198 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYCNP04198 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYCNP04198 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYCNP04198 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYCNP04198 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYCNP04198 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYCNP04198 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYCNP04198 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYCNP04198 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYCNP04198 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYCNP04198 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYCNP04198 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYCNP04198 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYCNP04198 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYCNP04198 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYCNP04198 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYCNP04198 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MYCNP04198 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYCNP04198 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYCNP04198 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYCNP04198 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYCNP04198 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MYCNP04198 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYCNP04198 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYCNP04198 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYCNP04198 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYCNP04198 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYCNP04198 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYCNP04198 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYCNP04198 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYCNP04198 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYCNP04198 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYCNP04198 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYCNP04198 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYCNP04198 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYCNP04198 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYCNP04198 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MYCNP04198 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYCNP04198 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYCNP04198 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYCNP04198 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYCNP04198 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYCNP04198 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms