Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP1P03956 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP1P03956 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP1P03956 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP1P03956 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP1P03956 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP1P03956 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP1P03956 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP1P03956 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP1P03956 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP1P03956 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP1P03956 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP1P03956 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP1P03956 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP1P03956 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP1P03956 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP1P03956 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP1P03956 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP1P03956 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP1P03956 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP1P03956 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP1P03956 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP1P03956 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP1P03956 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP1P03956 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP1P03956 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP1P03956 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP1P03956 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP1P03956 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP1P03956 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP1P03956 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP1P03956 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP1P03956 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP1P03956 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP1P03956 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP1P03956 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP1P03956 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP1P03956 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP1P03956 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP1P03956 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP1P03956 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP1P03956 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP1P03956 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP1P03956 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP1P03956 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP1P03956 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP1P03956 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP1P03956 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP1P03956 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP1P03956 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP1P03956 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP1P03956 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP1P03956 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP1P03956 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP1P03956 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP1P03956 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP1P03956 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP1P03956 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP1P03956 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MMP1P03956 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP1P03956 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP1P03956 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP1P03956 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP1P03956 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP1P03956 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MMP1P03956 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP1P03956 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP1P03956 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP1P03956 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP1P03956 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP1P03956 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP1P03956 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP1P03956 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP1P03956 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP1P03956 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP1P03956 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP1P03956 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP1P03956 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP1P03956 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP1P03956 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP1P03956 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP1P03956 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP1P03956 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP1P03956 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP1P03956 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP1P03956 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.6 ms