Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms