Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA1P02647 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA1P02647 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA1P02647 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOA1P02647 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOA1P02647 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOA1P02647 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOA1P02647 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOA1P02647 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOA1P02647 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOA1P02647 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOA1P02647 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOA1P02647 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOA1P02647 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOA1P02647 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOA1P02647 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOA1P02647 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOA1P02647 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOA1P02647 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOA1P02647 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOA1P02647 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOA1P02647 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOA1P02647 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOA1P02647 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOA1P02647 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOA1P02647 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOA1P02647 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOA1P02647 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOA1P02647 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOA1P02647 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOA1P02647 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOA1P02647 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOA1P02647 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOA1P02647 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOA1P02647 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOA1P02647 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOA1P02647 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOA1P02647 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOA1P02647 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOA1P02647 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOA1P02647 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOA1P02647 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOA1P02647 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOA1P02647 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOA1P02647 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOA1P02647 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOA1P02647 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOA1P02647 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOA1P02647 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOA1P02647 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOA1P02647 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOA1P02647 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOA1P02647 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOA1P02647 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOA1P02647 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOA1P02647 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOA1P02647 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOA1P02647 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOA1P02647 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOA1P02647 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOA1P02647 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOA1P02647 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOA1P02647 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOA1P02647 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOA1P02647 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOA1P02647 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOA1P02647 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms