Protein–RNA interactions for Protein: P01213

PDYN, Proenkephalin-B, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDYNP01213 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDYNP01213 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDYNP01213 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDYNP01213 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDYNP01213 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDYNP01213 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDYNP01213 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDYNP01213 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDYNP01213 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDYNP01213 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDYNP01213 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDYNP01213 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDYNP01213 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDYNP01213 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDYNP01213 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDYNP01213 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDYNP01213 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDYNP01213 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDYNP01213 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDYNP01213 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDYNP01213 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDYNP01213 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDYNP01213 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDYNP01213 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDYNP01213 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDYNP01213 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDYNP01213 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDYNP01213 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDYNP01213 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDYNP01213 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDYNP01213 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDYNP01213 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDYNP01213 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDYNP01213 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDYNP01213 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDYNP01213 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDYNP01213 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDYNP01213 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDYNP01213 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDYNP01213 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDYNP01213 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDYNP01213 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDYNP01213 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDYNP01213 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDYNP01213 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDYNP01213 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDYNP01213 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDYNP01213 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDYNP01213 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDYNP01213 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDYNP01213 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDYNP01213 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDYNP01213 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDYNP01213 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDYNP01213 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDYNP01213 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDYNP01213 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms