Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK4O96013 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK4O96013 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK4O96013 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK4O96013 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK4O96013 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK4O96013 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK4O96013 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK4O96013 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK4O96013 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK4O96013 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK4O96013 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAK4O96013 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK4O96013 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK4O96013 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK4O96013 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK4O96013 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK4O96013 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK4O96013 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK4O96013 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK4O96013 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK4O96013 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK4O96013 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK4O96013 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK4O96013 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAK4O96013 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAK4O96013 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK4O96013 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK4O96013 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK4O96013 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK4O96013 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK4O96013 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK4O96013 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK4O96013 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK4O96013 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAK4O96013 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAK4O96013 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAK4O96013 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAK4O96013 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAK4O96013 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAK4O96013 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAK4O96013 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAK4O96013 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAK4O96013 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAK4O96013 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAK4O96013 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAK4O96013 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAK4O96013 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAK4O96013 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAK4O96013 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAK4O96013 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAK4O96013 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAK4O96013 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAK4O96013 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK4O96013 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK4O96013 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK4O96013 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK4O96013 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK4O96013 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK4O96013 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK4O96013 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK4O96013 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK4O96013 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK4O96013 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK4O96013 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAK4O96013 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK4O96013 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK4O96013 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK4O96013 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK4O96013 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK4O96013 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK4O96013 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK4O96013 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAK4O96013 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAK4O96013 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAK4O96013 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAK4O96013 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAK4O96013 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAK4O96013 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAK4O96013 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAK4O96013 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAK4O96013 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAK4O96013 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAK4O96013 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms