Protein–RNA interactions for Protein: O95954

FTCD, Formimidoyltransferase-cyclodeaminase, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTCDO95954 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FTCDO95954 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FTCDO95954 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FTCDO95954 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FTCDO95954 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FTCDO95954 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FTCDO95954 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FTCDO95954 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FTCDO95954 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FTCDO95954 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FTCDO95954 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FTCDO95954 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FTCDO95954 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FTCDO95954 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FTCDO95954 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FTCDO95954 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FTCDO95954 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FTCDO95954 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FTCDO95954 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FTCDO95954 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FTCDO95954 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FTCDO95954 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FTCDO95954 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FTCDO95954 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FTCDO95954 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FTCDO95954 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FTCDO95954 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FTCDO95954 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FTCDO95954 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FTCDO95954 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FTCDO95954 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FTCDO95954 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FTCDO95954 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FTCDO95954 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FTCDO95954 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FTCDO95954 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FTCDO95954 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FTCDO95954 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FTCDO95954 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FTCDO95954 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FTCDO95954 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FTCDO95954 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FTCDO95954 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FTCDO95954 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FTCDO95954 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FTCDO95954 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FTCDO95954 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FTCDO95954 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FTCDO95954 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FTCDO95954 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FTCDO95954 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FTCDO95954 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FTCDO95954 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FTCDO95954 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FTCDO95954 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FTCDO95954 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FTCDO95954 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FTCDO95954 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FTCDO95954 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FTCDO95954 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FTCDO95954 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FTCDO95954 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FTCDO95954 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FTCDO95954 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FTCDO95954 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FTCDO95954 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FTCDO95954 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FTCDO95954 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FTCDO95954 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FTCDO95954 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FTCDO95954 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FTCDO95954 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FTCDO95954 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FTCDO95954 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FTCDO95954 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FTCDO95954 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FTCDO95954 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FTCDO95954 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FTCDO95954 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FTCDO95954 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FTCDO95954 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FTCDO95954 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FTCDO95954 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FTCDO95954 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FTCDO95954 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FTCDO95954 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FTCDO95954 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FTCDO95954 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FTCDO95954 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FTCDO95954 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FTCDO95954 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FTCDO95954 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FTCDO95954 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FTCDO95954 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FTCDO95954 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FTCDO95954 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FTCDO95954 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FTCDO95954 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FTCDO95954 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FTCDO95954 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms