Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PCNTO95613 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCNTO95613 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCNTO95613 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCNTO95613 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCNTO95613 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCNTO95613 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PCNTO95613 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCNTO95613 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCNTO95613 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCNTO95613 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCNTO95613 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCNTO95613 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCNTO95613 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCNTO95613 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCNTO95613 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCNTO95613 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCNTO95613 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCNTO95613 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCNTO95613 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCNTO95613 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCNTO95613 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCNTO95613 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCNTO95613 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCNTO95613 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCNTO95613 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCNTO95613 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCNTO95613 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCNTO95613 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCNTO95613 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCNTO95613 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCNTO95613 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCNTO95613 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCNTO95613 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCNTO95613 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCNTO95613 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCNTO95613 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCNTO95613 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCNTO95613 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCNTO95613 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCNTO95613 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCNTO95613 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCNTO95613 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCNTO95613 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCNTO95613 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCNTO95613 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCNTO95613 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCNTO95613 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCNTO95613 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCNTO95613 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCNTO95613 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCNTO95613 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCNTO95613 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCNTO95613 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCNTO95613 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNTO95613 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNTO95613 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNTO95613 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNTO95613 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNTO95613 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNTO95613 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNTO95613 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNTO95613 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNTO95613 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNTO95613 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNTO95613 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNTO95613 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNTO95613 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCNTO95613 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCNTO95613 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCNTO95613 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCNTO95613 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCNTO95613 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PCNTO95613 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PCNTO95613 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCNTO95613 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCNTO95613 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PCNTO95613 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCNTO95613 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCNTO95613 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCNTO95613 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNTO95613 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNTO95613 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNTO95613 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNTO95613 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNTO95613 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNTO95613 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNTO95613 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNTO95613 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNTO95613 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNTO95613 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNTO95613 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNTO95613 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCNTO95613 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCNTO95613 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCNTO95613 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCNTO95613 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCNTO95613 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCNTO95613 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCNTO95613 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms