Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYNGR4O95473 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms