Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF4AO95239 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF4AO95239 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF4AO95239 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms