Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN1O94985 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms