Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOO75962 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOO75962 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOO75962 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOO75962 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOO75962 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOO75962 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOO75962 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOO75962 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOO75962 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOO75962 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOO75962 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOO75962 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIOO75962 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIOO75962 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIOO75962 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIOO75962 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIOO75962 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIOO75962 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIOO75962 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIOO75962 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIOO75962 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIOO75962 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIOO75962 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIOO75962 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIOO75962 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIOO75962 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIOO75962 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIOO75962 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIOO75962 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIOO75962 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIOO75962 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIOO75962 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIOO75962 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIOO75962 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIOO75962 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIOO75962 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIOO75962 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIOO75962 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIOO75962 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIOO75962 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIOO75962 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIOO75962 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIOO75962 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIOO75962 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIOO75962 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIOO75962 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIOO75962 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIOO75962 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIOO75962 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIOO75962 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIOO75962 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIOO75962 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIOO75962 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIOO75962 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIOO75962 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIOO75962 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIOO75962 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIOO75962 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIOO75962 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIOO75962 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIOO75962 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIOO75962 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIOO75962 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIOO75962 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIOO75962 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIOO75962 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIOO75962 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms