Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRCPO75575 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRCPO75575 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRCPO75575 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRCPO75575 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRCPO75575 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRCPO75575 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRCPO75575 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRCPO75575 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRCPO75575 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRCPO75575 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRCPO75575 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRCPO75575 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRCPO75575 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRCPO75575 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRCPO75575 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRCPO75575 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRCPO75575 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRCPO75575 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRCPO75575 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRCPO75575 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRCPO75575 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRCPO75575 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRCPO75575 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRCPO75575 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRCPO75575 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRCPO75575 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRCPO75575 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRCPO75575 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRCPO75575 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRCPO75575 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRCPO75575 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRCPO75575 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRCPO75575 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRCPO75575 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRCPO75575 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRCPO75575 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRCPO75575 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRCPO75575 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRCPO75575 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRCPO75575 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRCPO75575 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRCPO75575 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRCPO75575 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRCPO75575 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRCPO75575 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRCPO75575 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRCPO75575 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRCPO75575 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRCPO75575 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRCPO75575 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRCPO75575 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRCPO75575 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRCPO75575 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRCPO75575 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRCPO75575 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRCPO75575 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRCPO75575 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRCPO75575 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRCPO75575 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRCPO75575 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRCPO75575 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRCPO75575 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRCPO75575 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRCPO75575 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRCPO75575 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRCPO75575 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRCPO75575 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRCPO75575 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRCPO75575 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRCPO75575 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRCPO75575 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms