Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSDE1O75534 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms