Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN5O75503 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN5O75503 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN5O75503 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN5O75503 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN5O75503 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN5O75503 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN5O75503 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN5O75503 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN5O75503 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN5O75503 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN5O75503 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN5O75503 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN5O75503 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN5O75503 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN5O75503 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN5O75503 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN5O75503 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN5O75503 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN5O75503 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN5O75503 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN5O75503 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN5O75503 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN5O75503 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN5O75503 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN5O75503 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN5O75503 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN5O75503 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN5O75503 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN5O75503 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN5O75503 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN5O75503 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN5O75503 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN5O75503 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN5O75503 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN5O75503 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN5O75503 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN5O75503 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN5O75503 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN5O75503 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN5O75503 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN5O75503 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN5O75503 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN5O75503 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN5O75503 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN5O75503 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN5O75503 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN5O75503 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN5O75503 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN5O75503 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN5O75503 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN5O75503 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN5O75503 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLN5O75503 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN5O75503 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN5O75503 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN5O75503 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN5O75503 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN5O75503 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN5O75503 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN5O75503 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN5O75503 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN5O75503 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN5O75503 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN5O75503 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN5O75503 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN5O75503 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms