Protein–RNA interactions for Protein: O75330

HMMR, Hyaluronan mediated motility receptor, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMMRO75330 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMMRO75330 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMMRO75330 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMMRO75330 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HMMRO75330 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HMMRO75330 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HMMRO75330 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HMMRO75330 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMMRO75330 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMMRO75330 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMMRO75330 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMMRO75330 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMMRO75330 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMMRO75330 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMMRO75330 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMMRO75330 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMMRO75330 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMMRO75330 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMMRO75330 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMMRO75330 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMMRO75330 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HMMRO75330 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HMMRO75330 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HMMRO75330 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HMMRO75330 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HMMRO75330 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HMMRO75330 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMMRO75330 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMMRO75330 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMMRO75330 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMMRO75330 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMMRO75330 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMMRO75330 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMMRO75330 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMMRO75330 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMMRO75330 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMMRO75330 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMMRO75330 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HMMRO75330 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMMRO75330 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMMRO75330 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMMRO75330 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMMRO75330 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMMRO75330 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMMRO75330 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMMRO75330 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMMRO75330 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMMRO75330 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMMRO75330 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMMRO75330 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMMRO75330 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMMRO75330 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMMRO75330 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMMRO75330 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMMRO75330 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMMRO75330 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMMRO75330 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMMRO75330 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMMRO75330 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMMRO75330 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMMRO75330 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMMRO75330 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMMRO75330 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMMRO75330 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMMRO75330 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMMRO75330 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMMRO75330 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMMRO75330 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMMRO75330 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMMRO75330 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMMRO75330 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMMRO75330 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMMRO75330 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMMRO75330 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMMRO75330 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMMRO75330 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMMRO75330 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMMRO75330 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HMMRO75330 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMMRO75330 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMMRO75330 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMMRO75330 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMMRO75330 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMMRO75330 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMMRO75330 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMMRO75330 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMMRO75330 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMMRO75330 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMMRO75330 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMMRO75330 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMMRO75330 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMMRO75330 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMMRO75330 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HMMRO75330 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMMRO75330 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMMRO75330 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMMRO75330 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMMRO75330 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMMRO75330 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HMMRO75330 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms