Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBNO60934 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBNO60934 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBNO60934 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBNO60934 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBNO60934 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBNO60934 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBNO60934 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBNO60934 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBNO60934 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBNO60934 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBNO60934 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBNO60934 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBNO60934 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBNO60934 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBNO60934 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBNO60934 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBNO60934 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBNO60934 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBNO60934 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBNO60934 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBNO60934 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBNO60934 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBNO60934 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBNO60934 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBNO60934 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBNO60934 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBNO60934 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBNO60934 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBNO60934 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBNO60934 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBNO60934 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBNO60934 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBNO60934 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBNO60934 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBNO60934 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBNO60934 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBNO60934 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NBNO60934 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBNO60934 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBNO60934 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBNO60934 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBNO60934 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBNO60934 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBNO60934 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBNO60934 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBNO60934 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBNO60934 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBNO60934 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NBNO60934 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBNO60934 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBNO60934 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBNO60934 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBNO60934 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBNO60934 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBNO60934 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBNO60934 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBNO60934 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBNO60934 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBNO60934 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NBNO60934 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NBNO60934 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NBNO60934 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBNO60934 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBNO60934 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBNO60934 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBNO60934 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBNO60934 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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