Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPR1O60356 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms