Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOX15O60248 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOX15O60248 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOX15O60248 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOX15O60248 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOX15O60248 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOX15O60248 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX15O60248 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX15O60248 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX15O60248 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX15O60248 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX15O60248 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX15O60248 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX15O60248 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX15O60248 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX15O60248 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX15O60248 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX15O60248 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX15O60248 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX15O60248 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX15O60248 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX15O60248 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX15O60248 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX15O60248 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX15O60248 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX15O60248 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX15O60248 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX15O60248 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX15O60248 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX15O60248 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX15O60248 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX15O60248 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX15O60248 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX15O60248 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX15O60248 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX15O60248 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX15O60248 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX15O60248 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX15O60248 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX15O60248 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX15O60248 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX15O60248 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX15O60248 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX15O60248 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX15O60248 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX15O60248 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.7 ms