Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
BNIP3LO60238 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms