Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMPRSS11DO60235 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS11DO60235 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms