Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DHX16O60231 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DHX16O60231 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DHX16O60231 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DHX16O60231 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DHX16O60231 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX16O60231 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX16O60231 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX16O60231 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX16O60231 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX16O60231 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX16O60231 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX16O60231 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX16O60231 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX16O60231 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX16O60231 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX16O60231 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX16O60231 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX16O60231 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX16O60231 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX16O60231 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX16O60231 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX16O60231 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX16O60231 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX16O60231 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX16O60231 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX16O60231 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX16O60231 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX16O60231 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX16O60231 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX16O60231 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX16O60231 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX16O60231 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX16O60231 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX16O60231 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DHX16O60231 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DHX16O60231 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DHX16O60231 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DHX16O60231 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DHX16O60231 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DHX16O60231 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DHX16O60231 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DHX16O60231 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DHX16O60231 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DHX16O60231 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DHX16O60231 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DHX16O60231 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DHX16O60231 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
DHX16O60231 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DHX16O60231 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DHX16O60231 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DHX16O60231 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DHX16O60231 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DHX16O60231 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DHX16O60231 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DHX16O60231 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DHX16O60231 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DHX16O60231 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DHX16O60231 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DHX16O60231 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DHX16O60231 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DHX16O60231 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DHX16O60231 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DHX16O60231 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX16O60231 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX16O60231 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX16O60231 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX16O60231 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX16O60231 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX16O60231 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX16O60231 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX16O60231 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX16O60231 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX16O60231 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX16O60231 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX16O60231 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DHX16O60231 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DHX16O60231 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DHX16O60231 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DHX16O60231 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DHX16O60231 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DHX16O60231 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DHX16O60231 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DHX16O60231 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DHX16O60231 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DHX16O60231 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DHX16O60231 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DHX16O60231 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DHX16O60231 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DHX16O60231 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DHX16O60231 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DHX16O60231 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DHX16O60231 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DHX16O60231 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DHX16O60231 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DHX16O60231 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DHX16O60231 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DHX16O60231 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DHX16O60231 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DHX16O60231 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms