Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LANCL1O43813 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LANCL1O43813 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms