Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNGR3O43761 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms