Protein–RNA interactions for Protein: O43747

AP1G1, AP-1 complex subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1G1O43747 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1G1O43747 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1G1O43747 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1G1O43747 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175 ms