Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DENRO43583 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DENRO43583 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DENRO43583 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DENRO43583 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DENRO43583 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DENRO43583 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DENRO43583 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DENRO43583 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DENRO43583 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DENRO43583 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DENRO43583 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DENRO43583 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DENRO43583 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DENRO43583 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DENRO43583 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DENRO43583 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DENRO43583 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DENRO43583 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DENRO43583 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DENRO43583 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DENRO43583 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DENRO43583 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DENRO43583 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DENRO43583 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DENRO43583 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DENRO43583 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DENRO43583 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DENRO43583 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DENRO43583 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DENRO43583 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DENRO43583 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DENRO43583 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DENRO43583 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DENRO43583 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DENRO43583 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DENRO43583 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DENRO43583 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DENRO43583 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DENRO43583 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DENRO43583 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DENRO43583 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DENRO43583 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DENRO43583 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DENRO43583 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DENRO43583 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DENRO43583 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DENRO43583 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DENRO43583 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DENRO43583 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DENRO43583 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DENRO43583 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DENRO43583 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DENRO43583 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DENRO43583 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DENRO43583 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DENRO43583 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DENRO43583 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DENRO43583 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DENRO43583 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DENRO43583 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DENRO43583 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DENRO43583 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DENRO43583 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DENRO43583 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DENRO43583 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DENRO43583 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DENRO43583 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DENRO43583 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DENRO43583 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DENRO43583 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DENRO43583 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DENRO43583 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DENRO43583 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DENRO43583 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DENRO43583 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DENRO43583 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DENRO43583 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DENRO43583 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DENRO43583 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms