Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBFA2T2O43439 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CBFA2T2O43439 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms